境内公司向关联香港公司提供技术咨询服务，根据《跨境应税行为适用增值税零税率和免税政策的规定》（财税〔2016〕36号）规定

一、中华人民共和国境内（以下称境内）的单位和个人销售的下列服务和无形资产，适用增值税零税率：

（三）向境外单位提供的完全在境外消费的下列服务：

• 研发服务。
• 软件服务。
• 电路设计及测试服务。
• 信息系统服务。

七、本规定所称完全在境外消费，是指：

（一）服务的实际接受方在境外，且与境内的货物和不动产无关。

据此，公司向境外单位提供的完全在境外消费的上述列举的技术服务，适用增值税零税率。否则，按6%计缴增值税。

关于免税：
《营业税改征增值税跨境应税行为增值税免税管理办法（试行）》（国家税务总局公告2016年第29号）第二条第（十四）规定，向境外单位销售的完全在境外消费的专业技术服务。
下列情形不属于完全在境外消费的专业技术服务：
1. 服务的实际接受方为境内单位或者个人
2. 对境内的天气情况、地震情况、海洋情况、环境和生态情况进行的气象服务、地震服务、海洋服务、环境和生态监测服务。
3. 为境内的地形地貌、地质构造、水文、矿藏等进行的测绘服务。
4. 为境内的城、乡、镇提供的城市规划服务。

国家税务总局公告2016年第29号第五条规定， 纳税人发生本办法第二条所列跨境应税行为，除第（九）项、第（二十）项外，必须签订跨境销售服务或无形资产书面合同。否则，不予免征增值税。

关于备案手续：
国家税务总局公告2016年第29号第八条规定宁， 纳税人发生免征增值税跨境应税行为，除提供第二条第（二十）项所列服务外，应在首次享受免税的纳税申报期内或在各省、自治区、直辖市和计划单列市国家税务局规定的申报征期后的其他期限内，到主管税务机关办理跨境应税行为免税备案手续，同时提交以下备案材料：

（一）《跨境应税行为免税备案表》（附件1）；
（二）本办法第五条规定的跨境销售服务或无形资产的合同原件及复印件；
（三）提供本办法第二条第（一）项至第（八）项和第（十六）项服务，应提交服务地点在境外的证明材料原件及复印件；
（四）提供本办法第二条规定的国际运输服务，应提交实际发生相关业务的证明材料；
（五）向境外单位销售服务或无形资产，应提交服务或无形资产购买方的机构所在地在境外的证明材料；
（六）国家税务总局规定的其他资料。

关于发票：
国家税务总局公告2016年第29号第七条规定， 纳税人发生跨境应税行为免征增值税的，应单独核算跨境应税行为的销售额，准确计算不得抵扣的进项税额，其免税收入不得开具增值税专用发票。已开具增值税专用发票的，应将全部联次追回后方可办理跨境应税行为免税备案手续。