香港发工资是否会体现在内地个税证明上，主要取决于多个因素，包括个人的税收居民身份、收入来源、以及内地与香港之间的税收协定等。以下是对这一问题的详细分析：

一、税收居民身份
首先，需要确定个人是否为内地税收居民。根据《中华人民共和国个人所得税法》及其实施条例，内地税收居民应就其全球所得在内地纳税，而非居民个人则仅就其境内所得纳税。因此，如果个人被判定为内地税收居民，那么无论其收入来源于何处，包括香港发放的工资，都可能需要在内地申报并体现在个税证明上。

二、收入来源与性质
其次，需要关注收入来源与性质。如果香港发放的工资属于个人在内地提供劳务所得（例如，个人在内地工作，但工资由香港公司支付），那么这部分收入通常会被视为来源于内地的所得，并需要在内地缴纳个人所得税。相应地，这部分收入也会体现在内地的个税证明上。

三、内地与香港的税收协定
此外，还需要考虑内地与香港之间的税收协定。根据《内地和香港特别行政区关于对所得避免双重征税和防止偷漏税的安排》，双方对居民在对方境内取得的所得有一定的征税权规定。在某些情况下，即使个人在内地没有住所或居住时间不满足内地税收居民的条件，但如果其在香港取得的工资与在内地提供的劳务有关，且满足特定条件（如停留天数不超过一定期限等），这部分收入也可能需要在内地纳税。然而，具体是否需要在内地纳税以及如何在个税证明上体现，还需根据税收协定的具体条款和实际情况来判断。

四、实际操作流程
在实际操作中，如果个人在香港取得的工资需要在内地纳税，那么个人或雇主通常需要在内地税务机关进行纳税申报。申报时，需要提供相关的收入证明和税务文件。税务机关会根据提供的材料和税收法规来核定应纳税额，并出具相应的个税证明。因此，如果香港发放的工资确实需要在内地纳税，那么它最终会体现在内地的个税证明上。

综上所述，香港发工资是否会体现在内地个税证明上，取决于个人的税收居民身份、收入来源与性质以及内地与香港之间的税收协定等多个因素。在实际操作中，建议咨询专业的税务顾问或税务机关以获取准确的信息和指导。